生物布局的一种主要手段冷冻电子显微镜是获取,特定的算法来进行处置大量的数据需要颠末。了基于贝叶斯的算法RELION 实现,U 进行加快计较并能够操纵 GP。ION 的编译安装与运转本次会商会将引见 REL,例子为根本并以典型,的资本利用环境连系计较使命,GPU 使命分派体例引见合理的 CPU/,物布局解析从而加快生。
w 及 IndeX 的安装和利用方式本次研讨会将重点阐述 ParaVie,、算力需求及扩展性进行讲解并对 GPU 的支撑环境。
识店肆以视频直播形式进行研讨会将在智工具公开课知,:30 起头从下战书 13,16:15持续到 。中其,:15 为问答环节16:00-16,将在线答疑三位主讲人。
月起5 ,U 加快高机能计较(HPC)典范使用在线研讨会」智工具公开课与 NVIDIA 配合筹谋推出「GP,设两场打算开。能计较和科学计较使用研讨会聚焦典范高性,平台更好的加快这些使用以及若何在 GPU 。
26 日5 月 ,典范使用在线研讨会」第一场已成功完结「GPU 加快高机能计较(HPC)。决方案架构师戴志翔和处理方案架构师马四腾三位手艺专家主讲第一场由 NVIDIA(英伟达)高级系统架构师易成、解,大软件:LAMMPS、GROMACS 和 VASP重点切磋了使用于分子动力学和材料电子布局计较的三。底部「阅读原文」收看完整回放错过直播的伴侣能够点击文章。

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电子布局计较和纳米标准材料建模的开源计较软件包Quantum Espresso 是普遍用于,论、平面波和赝势方式它次要基于密度泛函理。esso 最新版本在 GPU 上的支撑环境本次研讨会将引见 Quantum Espr, Quantum Espresso以及若何更好地在 GPU 上利用,基于源码编译安装包罗利用容器、,最佳实践等以及运转。
架构师况吕林、处理方案架构师匡磊三位手艺专家NVIDIA 处理方案架构师石道辰、处理方案,sso 进展及使用》、《GPU 加快 ParaView & IndeX 数据可视化》为主题进行直播讲解将别离以《利用 GPU 加快 RELION 生物布局解析》、《GPU 加快 Quantum Espre。
研究范畴已逐步成为不成或缺的主要手段之一高机能计较在严重科学发觉的前沿根本科学。构计较、材料模仿到 HPC 数据可视化从分子动力学模仿、生物制药、材料电子结,能计较的支撑都离不开高性。
于计较稠密型使用这类使用软件都属,、I/O 要求高档特点具有计较量大、通信稠密,用 GPU 并行处置能力凡是需要跨多个计较节点利,靠得住、快速地运转来包管其高效、。
跟着复杂的数据量以及高计较力需求高机能计较和科学计较的过程往往伴,使用软件来提拔效率同时需要借助特地的。MMPS、模仿软件 GROMACS好比面向分子动力学的计较软件 LA,计较的 VASP面向材料电子布局,据处置软件 RELION以及冷冻电镜三维图像数,及 HPC 数据可视化东西 ParaView & IndeX 等 HPC 典范使用软件面向电子布局计较和纳米标准材料建模的开源软件包 Quantum Espresso 以,大幅提拔工作效率可以或许协助科学家,学发觉加快科。
22 日6 月 ,)典范使用在线研讨会」第二场将开讲「GPU 加快高机能计较(HPC。m Espresso 和 HPC 数据可视化东西 ParaView & IndeX 在 GPU 上的安装、摆设和优化加快方式此次研讨会将重点切磋冷冻电镜三维图像数据处置软件 RELION、电子布局计较和纳米标准材料建模的开源计较软件包 Quantu。
石道辰1、,GPU 加快 RELION 生物布局解析NVIDIA 处理方案架构师:《利用 》
时同,家交换和征询为了便利大,典范使用在线研讨会」还设置了专属交换群针对「GPU 加快高机能计较(HPC),主讲人插手将会邀请。人世接认识和交换的伴侣但愿插手交换群与主讲,秋进行申请也能够向瑞。
在现, — HPC 中最风行的可视化东西之一IndeX 已集成到 ParaView。aView 默认拜候 IndeX 功能这意味着用户能够利用最新版本的 Par,可视化的及时交互性并体验到与现无数据。
对于科学发觉至关主要快速可视化模仿成果。是但,构化和非布局化数据集的及时体验现有的可视化东西无法供给大型结。领先的 HPC 数据可视化东西NVIDIA IndeX 是,对这一挑战有助于应。GPU 的计较能力IndeX 操纵 ,集群平分布可视化工作负载通过在 GPU 加快的,的及时可视化机能来供给大型数据集。
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